Semillero de R - FacCA

Ecosistema R Markdown II

Resumen R Markdown 1

  • Definición de markdown.
  • Flujo de trabajo inicial con R Markdown.
    • File -> New File -> R Markdown.
    • Guardar con codificación UTF-8.
  • Componentes de R Markdown:
    • Metadatos. (--- ---)
    • Fragmentos de R. (```{r} ```)
  • Teclas de acceso rápido:
    • Ctrl + Alt + i: insertar código R.
    • Ctrl + Shift + k: compilar el documento a formato .html.
  • Elementos básicos: títulos, viñetas, opciones de texto, insertar imagenes, insertar hipervínculos.
  • Publicación de documentos en Rpubs.
  • R Markdown: The Definitive Guide

Formatos de salida

  • R Markdown proporciona dos tipos de salidas:
    1. Documentos
      • html_document
      • github_document
      • latex_document
      • md_document
      • odt_document
      • pdf_document
      • rtf_document
      • word_document
    2. Presentaciones (diapositivas)
      • ioslides_presentation
      • slidy_presentation
      • beamer_presentation
      • power_presentation

Sintaxis de R Markdown

Sintaxis de R Markdown I

  • Encabezados: #, ##.
  • *Cursiva*
  • **Negrilla**
  • *Negrilla cursiva*
  • Insertar imagen: ![](imagen.png)
  • Insertar hipervínculo: [](url.com)

Sintaxis de R Markdown II

  • Marcado de texto con comillas transversas `mean()`
  • Texto con opción de celda de código: ```ejemplo```
  • Ejecución de código en línea de texto: ```letra r código```
  • Más opciones de texto:
    • H~3~PO~4~ —-> H3PO4
    • 2^2^ —-> 22
    • Insertar citación o notas al pie del texto con ^[] —-> Semillero R1
    • Salto de línea en markdown con <br>.

Sintaxis de R Markdown II

  • Citas textuales con `>`
> "I thoroughly disapprove of duels. If a man should challenge me,
  I would take him kindly and forgivingly by the hand and lead him
  to a quiet place and kill him."
>
> --- Mark Twain

“I thoroughly disapprove of duels. If a man should challenge me, I would take him kindly and forgivingly by the hand and lead him to a quiet place and kill him.”

— Mark Twain

Sintaxis de R Markdown II

  • Expresiones matemáticas
    • $$Latex$$: ecuación centrada con salto de línea.
    • $Latex$: ecuación en línea.
    • Ejemplos:
      • $f(x) = {n \choose k} p^{x}(1-p)^{n-x}$
        • En línea \(f(x) = {n \choose k} p^{x}(1-p)^{n-x}\)
      • $$f(x) = {n \choose k} p^{x}(1-p)^{n-x}$$ \[f(x) = {n \choose k} p^{x}(1-p)^{n-x}\]
  • Documentación Latex.
  • Símbolos matemáticos en Latex.

Sintaxis de R Markdown II

  • Tablas 1:
Columna 1 | Columna 2 | Columna 3
--------- | --------- | ---------
Dato 1    | Dato 2    | Dato 3
Columna 1 Columna 2 Columna 3
Dato 1 Dato 2 Dato 3


- Tablas 2:

Columna 1 | Columna 2 | Columna 3
 :------: | --------: | :------
Dato 1    | Dato 2    | Dato 3
Dato 1    | Dato 2    | Dato 3
Columna 1 Columna 2 Columna 3
Dato 1 Dato 2 Dato 3
Dato 1 Dato 2 Dato 3

Editando documentos html

Metadatos

  • title: título principal del documento.
  • subtitle: subtítulo.
  • date: fecha.
  • output: tipo de salida.
    • toc: opción para activar tabla de contenidos.
    • toc_depth: configurar los encabezados a tener en cuenta para la tabla de contenidos.
    • toc_float: tabla de contenido flotante.
      • collapsed: tabla de contenido flotante y plegable.
      • smooth_scroll: animaciones de tabla de contenido con el clic.
    • number_sections: numeración de secciones.
    • theme: tema del documento.
    • highlight: estilo de resaltado.
    • df_print: impresión de data.frame con formato.
    • code_folding: opción que permite mostrar u ocultar el código en el documento.
    • css: personalización avanzada a través de css.

Fragmentos de R

  • Insertar fragmento de R con Ctrl + ALt + i.
  • fig.align: alineación de figuras e imágenes.
  • fig.width: ancho de gráficos.
  • fig.height: altura de gráficos.
  • out.width: ancho de imágenes.
  • out.height: alto de imágenes.
  • echo: opción para imprimir el código en el documento.
  • eval: opción para evaluar el código, es decir, producir resultados.
  • warning: opción para desactivar las advertencias.
  • message: opción para desactivar los mensajes.

Metadatos y chunk de R

  • Plantilla de metadatos:
---
title: "Título"
subtitle: "Subtítulo"
author: "Nombre Apellido"
date: "01 de enero de 1900"
output:
  html_document:
    toc: true
    toc_depth: 3
    toc_float: true
      collapsed: true
      smooth_scroll: true
    number_sections: true
    theme: readable
    highlight: tango
    df_print: paged
    code_folding: hide
    css: estilo.css
---
  • Plantilla fragmento de R:
``{r, fig.align='center', fig.width=8, fig.height=5, echo=TRUE, eval=TRUE}

``

Presentaciones

Presentación ioslides

  • Crear archivo de extensión .Rmd
    • File -> New File -> R Mardown -> Presentation -> Ioslides

  • Guardar archivo .Rmd
    • File -> Save with Encoding -> UTF-8.
  • Nueva diapositiva con ##.
  • Diapositiva de tema principal con #.

Notas

  1. https://unal-semilleror-facca.github.io/↩︎